กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์
Department of Medical Sciences

ทะเบียนองค์ความรู้
การตรวจหาลำดับเบสทั้งจีโนมของเชื้อวัณโรคด้วยเทคนิควิเคราะห์ลำดับเบสรุ่นใหม่   (ภาษาไทย)
Whole Genome Sequencing of Mycobacteria using Next Generation Seuquencing.   (ภาษาอังกฤษ)

หน่วยงาน


สถาบันชีววิทยาศาสตร์ทางการแพทย์

ระยะเวลาในการดำเนินการ


 

งบประมาณ


เริ่มวันที่:1 เดือน มีนาคม พ.ศ. 2560 จนถึงวันที่: 31 เดือน มีนาคม พ.ศ. 2561 รวม:1 ปี จำนวนเงิน:0.00 บาท

 รายชื่อผู้ร่วมดำเนินการ


ลำดับชื่อ-นามสกุลตำแหน่งในโครงการ
1 นายสุรัคเมธ มหาศิริมงคล หัวหน้าโครงการ
2 นางนวลจันทร์ วิจักษณ์จินดา ผู้ร่วมวิจัย
3 นางสาวเพ็ญพิชชา ถาวงศ์ ผู้ร่วมวิจัย
4 นางสาวปุณฑริกา ไพบูลย์ศิริ ผู้ร่วมวิจัย

 บทคัดย่อ


การถอดรหัสจีโนมเชื้อวัณโรคด้วยเทคโนโลยี Next-generation sequencing ถูกพัฒนาขึ้น เพื่อบ่งบอกการดื้อต่อยาต้านวัณโรค และการแพร่ระบาดของเชื้อวัณโรค คณะผู้วิจัยได้พัฒนาการตรวจวิเคราะห์ด้วยการถอดรหัสจีโนมของเชื้อวัณโรคจำนวน 126 ตัวอย่าง ตรวจสอบความใช้ได้ของการตรวจวิเคราะห์ โดยพิจารณาค่าความไว ความจำเพาะ การทำนายเชิงบวก และการทำนายเชิงลบ ในการรายงานผลดื้อยา และประสิทธิภาพจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคจากการถอดรหัสจีโนมเทียบกับ Spoligotype ซึ่งเป็นวิธีมาตรฐานในการตรวจสายพันธุ์ของเชื้อวัณโรค ผลการทดสอบพบว่า การตรวจวิเคราะห์รหัสจีโนมที่พัฒนาขึ้น สามารถตรวจการดื้อต่อกลุ่มยาต้านวัณโรคแนวที่ 1 และ 2 รวมทั้งภาวะของเชื้อดื้อยา โดยให้ค่าความไวร้อยละ 80.0 – 100.0 และค่าความจำเพาะร้อยละ 88.6 – 100.0 ซึ่งเทียบเท่าหรือสูงกว่า ค่าที่ได้จากระบบวิเคราะห์รหัสจีโนมของเชื้อวัณโรคโดยคณะผู้วิจัยจากประเทศอังกฤษ การทดสอบความถูกต้องของการตรวจวิเคราะห์ พบว่าการทำนายเชิงบวก และการทำนายเชิงลบ อยู่ที่ร้อยละ 80.0 – 100.0 และ 89.1 – 100.0 ตามลำดับ และทำให้ทราบผลวัณโรคดื้อยาหลายขนาน และดื้อยาหลายขนานชนิดรุนแรง ได้ภายใน 1 สัปดาห์ หลังจากผลการเพาะเชื้อเป็นบวก ลดลงจากระยะเวลาปกติที่ใช้เวลา 4 – 12 สัปดาห์ โดยวิธีทางจุลชีววิทยา การตรวจวิเคราะห์รหัสจีโนมมีค่าดัชนีอำนาจจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อวัณโรค (Discriminatory index) ที่ 0.7511 ซึ่งสูงกว่า Discriminatory index ของ Spoligotype ที่ 0.2406 โดยประสิทธิภาพจำแนกที่สูงนี้ ทำให้สามารถแยกคลัสเตอร์การระบาดของเชื้อวัณโรคได้ การตรวจวิเคราะห์ที่พัฒนาขึ้นได้นำมาใช้ในการถอดรหัสจีโนมของเชื้อวัณโรค ภายใต้โครงการเฝ้าระวังการดื้อยาวัณโรคของประเทศไทย ครั้งที่ 5 เพื่อศึกษาอัตราการดื้อยา และระบาดวิทยาเชิงโมเลกุลของเชื้อวัณโรคในประเทศไทย    

 การเผยแพร่


ลำดับกิจกรรมรายละเอียดระยะเวลา
1 ร่วมนำเสนอด้วยการพูดในงานวิชาการ การประชุมวิชาการ 100 ปี การสาธารณสุขไทย. วันที่ 18 - 20 กรกฎาคม 2561 ณ ศูนย์แสดงสินค้าและการประชุมอิมแพ็ค เมืองทองธานี นำเสนอผลงานแบบปากเปล่า เริ่ม: 18 ก.ค. 2561 สิ้นสุด: 20 ก.ค. 2561

 รางวัลที่ได้รับ




ฐานข้อมูลองค์ความรู้ เทคโนโลยีและนวัตกรรม
กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์
http://innovation.dmsc.moph.go.th
ข้อมูล ณ วันที่:๒๑ ต.ค. ๒๕๖๔